Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF35P13682 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms