Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGA4P13612 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ITGA4P13612 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms