Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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DEFA4P12838 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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DEFA4P12838 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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DEFA4P12838 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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DEFA4P12838 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
DEFA4P12838 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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