Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ACTN1P12814 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ACTN1P12814 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms