Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BMP3P12645 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BMP3P12645 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BMP3P12645 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BMP3P12645 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms