Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COX6A1P12074 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms