Protein–RNA interactions for Protein: P11586

MTHFD1, C-1-tetrahydrofolate synthase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD1P11586 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MTHFD1P11586 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms