Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TOP1P11387 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TOP1P11387 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TOP1P11387 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TOP1P11387 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms