Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI2P10070 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI2P10070 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI2P10070 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI2P10070 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GLI2P10070 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GLI2P10070 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GLI2P10070 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GLI2P10070 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI2P10070 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI2P10070 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI2P10070 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI2P10070 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI2P10070 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI2P10070 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI2P10070 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GLI2P10070 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GLI2P10070 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GLI2P10070 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GLI2P10070 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms