Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CCDC192P0DO97 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms