Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SAA1P0DJI8 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms