Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SERPIND1P05546 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPIND1P05546 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms