Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR3DP05423 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR3DP05423 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms