Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL4A1P02462 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms