Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POP4O95707 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
POP4O95707 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
POP4O95707 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
POP4O95707 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms