Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFT2D2O95562 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFT2D2O95562 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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