Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAPBO95292 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAPBO95292 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAPBO95292 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAPBO95292 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAPBO95292 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VAPBO95292 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VAPBO95292 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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