Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBXN7O94888 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms