Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFL1O94874 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UFL1O94874 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UFL1O94874 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFL1O94874 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
UFL1O94874 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFL1O94874 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms