Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ATG12O94817 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ATG12O94817 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms