Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SKAP2O75563 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SKAP2O75563 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms