Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD4O60885 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRD4O60885 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRD4O60885 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRD4O60885 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
BRD4O60885 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BRD4O60885 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD4O60885 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD4O60885 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD4O60885 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD4O60885 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD4O60885 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD4O60885 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
BRD4O60885 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms