Protein–RNA interactions for Protein: O60840

CACNA1F, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, humanhuman

Predictions only

Length 1,977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1FO60840 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CACNA1FO60840 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1FO60840 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1FO60840 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1FO60840 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1FO60840 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1FO60840 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1FO60840 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1FO60840 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1FO60840 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CACNA1FO60840 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms