Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
TIMM17BO60830 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
TIMM17BO60830 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms