Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR3O43761 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms