Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HTATSF1O43719 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HTATSF1O43719 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms