Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
E2F3O00716 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
E2F3O00716 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
E2F3O00716 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms