Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
AGRNO00468 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
AGRNO00468 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
AGRNO00468 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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