Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOC4-APOC2K7ER74 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
APOC4-APOC2K7ER74 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms