Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KRBOX1C9JBD0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms