Protein–RNA interactions for Protein: B7Z8K6

TRDC, T-cell receptor delta chain C region, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDCB7Z8K6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRDCB7Z8K6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms