Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
B4E171 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4E171 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4E171 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4E171 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4E171 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
B4E171 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
B4E171 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
B4E171 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4E171 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4E171 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
B4E171 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4E171 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4E171 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4E171 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
B4E171 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms