Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ZNF839A8K0R7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms