Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms