Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
STRCP1A6NGW2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms