Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CFAP73A6NFT4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms