Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZNF316A6NFI3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZNF316A6NFI3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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