Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
LINC00862A6NCI5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00862A6NCI5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms