Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PSDA5PKW4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PSDA5PKW4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms