Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WWV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WWV3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A0A087WWV3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A0A087WWV3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
A0A087WWV3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.28■■□□□ 1
A0A087WWV3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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