Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
U3KQ87 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
U3KQ87 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
U3KQ87 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms