Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUBP2Q9Y5Y2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms