Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PAXBP1Q9Y5B6 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms