Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAF6Q9Y4K3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF6Q9Y4K3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms