Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
DTX4Q9Y2E6 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms