Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFSF18Q9UNG2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFSF18Q9UNG2 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms