Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
USP18Q9UMW8 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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USP18Q9UMW8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
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USP18Q9UMW8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
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