Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PALD1Q9ULE6 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms