Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BRPF3Q9ULD4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRPF3Q9ULD4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms