Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL62

TRPC5, Short transient receptor potential channel 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC5Q9UL62 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRPC5Q9UL62 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms